Plateformes Lilloises en Biologie et Santé

PLBS | UAR 2014 - US 41
Biologie et santé Plateforme Unité de recherche Santé de précision Sciences pour une planète en mutation Monde numérique au service de l'humain

Les sept plateformes constitutives de PLBS propose un accès aux équipements et expertises indispensables au soutien de l’activité de recherche en biologie et en santé. Les approches technologiques, analytiques et méthodologiques proposées par PLBS s’étendent du développement de l’étude des omiques à l’imagerie cellulaire, l’imagerie du vivant et l’exploration fonctionnelle en passant par la bioinformatique et biostatistique, le criblage à haut débit/haut contenu et les moyens en hébergement de modèles expérimentaux. 
En premier lieu développé pour répondre aux besoins des unités de recherche académiques en sciences de la vie et de la santé de l'Université de Lille, PLBS est également ouvert à l’activité de recherche académique nationale et internationale ainsi qu’au secteur privé.

Informations

Direction adjointe : Philippe Boutin
Direction : Sophie Crespin

https://ums-plbs.univ-lille.fr/
https://twitter.com/UMS_PLBS?s=20

1 place de Verdun
Faculté de Médecine - Pôle Recherche, Université de Lille
59045 LILLE

Mots-clés

Criblage à haut contenu et à haut débit, Cytométrie, Microscopie photonique et électronique, Bioinformatique, Génomique, Transcriptomique, Imagerie TEP et IRM, Exploration fonctionnelle, Glycoprotéomique, Traitement d'images et du signal

Localisation

ARIADNE-Criblage :

  • Criblage à haut contenu et à haut débit
  • Automatisation des criblages
  • Microscopie confocale automatisée
  • Caractérisation de cibles et l’optimisation des modulateurs

BICeL :

  • Imagerie électronique à transmission (MET) et balayage (MEB)
  • Microscopie photonique
  • Cytométrie conventionnelle et spectrale, imagerie en flux et tri cellulaire
  • Préparation des échantillons
  • Imagerie intravitale
  • Analyse et l’interprétation des données
  • Analyse d'images

Bilille :

  • Développement de pipelines d’analyse et de bases de données
  • Biologie intégrative
  • Annotation de gènes, de génomes et de protéines
  • Phylogénie
  • Biologie des systèmes
  • Bioinformatique structurale
  • Développement d'outils bioinformatiques et biostatistiques

Genomic @ Lille :

  • Génomique « génomes entiers »
  • Transcriptomique
  • Métagénomique
  • Séquençage et re-séquençage de génomes entiers
  • Re-séquençage d’exomes de diverses qualités
  • Séquençage ciblé
  • Métagénomique ciblée 16S
  • RNA-seq et scRNA-seq
  • DGE microarrays et DGE Nanostring

LIIFE :

  • Acquisition en imagerie in vivo en IRM et TEP
  • Recherche translationnelle
  • Approches multidisciplinaires (radiologie, médecine nucléaire, ingénierie)
  • Exploration fonctionnelle et comportementale
  • Traitement et analyse d’images

PAGés - P3M :

  • Composition et quantification en monosaccharide
  • Etude de mélange complexe de glycannes, poly- et oligo-saccharides
  • Glycobiologie structurale
  • Spectroscopie RMN (résonance magnétique nucléaire)
  • Protéomique haut débit
  • Etude des modifications post-traductionnelles
  • Glyco protéomique
  • Spéctrométrie de masse native

Animaleries :

  • Hébergement de rongeurs et modèles aquatiques
  • Elevage de lignées transgéniques
  • Explorations fonctionnelles et métaboliques
  • Analyse de composition corporelle

Exemples de projets :

  • MuDiS4LS : projet d'espaces numériques mutualisés pour les sciences du vivant
  • ARIANES : brain MRI regional network

Pour les prestations de service spécialisées, consulter les profils de nos plateformes :

  • Génomique (GO@L)
  • Glycomique & protéomique (PAGés-P3M)
  • Bioinformatique & biostatistique (bilille)
  • Animaleries (Ressources expérimentales)
  • Imagerie cellulaire (BICeL)
  • Imagerie du vivant & fonctions (LIIFE)
  • Criblage HCS-HTS (Ariadne-criblage)

La majeure partie des équipements de PLBS est rendue accessible à la communauté à l'issue d'une formation pratique. Les personnes ainsi formées peuvent alors utiliser les équipements de manière autonome tout en bénéficiant de l'assistance des ingénieur.e.s et technicien.ne.s des plateformes.
Pour les équipements nécessitant une connaissance approfondie, placés dans des confinements spécifiques et/ou particulièrement sensibles, l'accès peut être limité au mode collaboratif ou via une prestation de recherche ou de service.

Pour découvrir la liste détaillée des équipements, consulter les profils de nos plateformes :

  • Génomique (GO@L)
  • Glycomique & protéomique (PAGés-P3M)
  • Bioinformatique & biostatistique (bilille)
  • Animaleries (Ressources expérimentales)
  • Imagerie cellulaire (BICeL)
  • Imagerie du vivant & fonctions (LIIFE)
  • Criblage HCS-HTS (Ariadne-criblage)

Privés
Bioversys, Apteeus, GSK, Copalis, ANSES, OCR, Gènes Diffusion, Philips, General Electric, Siemens, Qynapse, Cleverdoc

Académiques
Institut Pasteur Paris, Institut Necker Paris, Paris Orsay, Université Paris Sud - Institut Galien, Institut Polytechnique de Paris, Institut Curie, Institut Cochin, Université de Technologie de Compiègne, Université de Toulouse, Sorbonne Université, Université du Littoral Côte d'Opale, Université de Rouen, Université d'Angers, Polytech Montpellier, CHU de Rouen, CHU de Nantes, CHU de Marseille, CHU d'Amiens-Picardie, CHU de Bordeaux, Hôpital Fondation Rothschild (Paris), UMR5240 - Microbiologie, Adaptation et Pathogénie, Plateforme "Exploration du Métabolisme" INRA Clermont-Ferrand, U1086 ANTICIPE (Rouen), U1209 IAB (Grenoble),  UMR7339 CRMBM (Marseille)
Université Libre de Bruxelles (Belgique), Sciensano (Belgique), Institut Weizmann pour les Sciences (Israel), Paul Langherans Institute Dresden (Allemagne), University hospital of Munich (Allemagne), Université de Nagoya (Japon), Université de Sheffield (Grande Bretagne), Massachusetts General Hospital (Etats-Unis), University of Chicago (Etats-Unis), University hospital of Maastricht (Pays-Bas)