Plateforme de glycomique et protéomique

PAGès-P3M

Biologie et santé Plateforme Santé de précision Sciences pour une planète en mutation

PAGés-P3M est l'unique plateau français labélisé IBiSa dédié à l’analyse globale des glycanes seuls, des glycopeptides et de glycoprotéines entières. Issu et adossé à l’Unité de Glycobiologie Structurelle et Fonctionnelle UMR8576, PAGés-P3M profite de 20 ans d’expérience dans l’étude des glycosylations. La plateforme dispose de solides expertises en :
- RMN, chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse pour l’identification des sucres et glycannes complexes,
- analyse glycoprotéomique pour la localisation des glycosylations,
- spectrométrie de masse des glycoprotéines entières pour la quantification des glycoformes et l’étude des interactions avec ligand ou protéine partenaires. Ouvert aussi bien au monde industriel qu'au monde académique, PAGés-P3M propose de répondre à vos besoins quel que soit votre projet : formation, utilisation d’instrument, prestation, développement.

Informations

Responsable technique : Nao Yamakawa
Responsable scientifique : Jean-Michel Saliou (P3M)
Responsable scientifique : Emmanuel Maes (PAGés)

https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/glycomique-proteomique

Bâtiment C9, Avenue Mendeleiev
Campus Cité Scientifique, Université de Lille
59655 VILLENEUVE D'ASCQ

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Mots-clés

Glycomique, Glycoprotéomique, Protéomique, Polysaccharides, Oligosaccharides, Glycolipides, Gangliosides, Glycoproteines, Chromatographie, Spectrométrie de Masse

Localisation

Composition et quantification en monosaccharide
Etude de mélange complexe de glycanes, poly- et oligo-saccharides
Glycobiologie structurale
Spectroscopie RMN (résonance magnétique nucléaire)
Protéomique haut débit
Etude des modifications post-traductionnelles
Glyco protéomique
Spéctrométrie de masse native
Séquence primaire, configuration et anomérie de glycannes
Détermination de l’état de sialylation
Etude d’interaction moléculaire biospécifique
Purification de biomolécules
Chromatographie en phase gazeuse
Chromatographie liquide
Spectrométrie de Masse
Approches multi-techniques
Quantification avec ou sans marquage

Exemples de projets :

Développement d’une méthode d’analyse des acides sialiques acétylés dans le cadre d’une étude sur la carcinogenèse mammaire
Développement d’une méthode d’analyse des sucres de type acide sialique (i.e. acides légionaminiques, ou pseudaminiques) dans les bactéries
Analyse systématique du glycome des organes d’un vertébré
Développement d’une méthode d’analyse du taux de substitution des cyclodextrines
Co-développement d’une méthode pour déterminer les N-glycome spécifiques des sites de glycosylation des IgG par analyse des glycopeptides en LC/MS2
Analyse quantitative des glycopeptides d'IgG
Analyse protéomique d'événements de maturation protéique PMID: 28958858
Protéomique haut débit sur pull-down
Analyse structurale complète des glycosylations par glycomique, glycoprotéomique et analyse de glycoprotéine entière

Analyse structurale des glycannes et glycoconjugués sous toutes leurs formes, i.e. glycolipides, glycoprotéines, polysaccharides, oligosaccharides.
Analyses de composition en monosaccharides (chimie, phase gazeuse, spectrométrie de masse, RMNprotons et hétéroatomes)
Analyse quantitative des glucides dans des mélanges complexes et des matrices.
Analyse protéomique quantitative (immunopeptidome, interactome, proteome complet)
Analyse glycoprotéomique
Analyse de masse native (LC-MS, ESI-MS)
Quantification et dosage en monosaccharides
Analyses de séquences (spectrométrie de masse, RMN)
Analyses des cartes glycaniques de glycoprotéines (spectrométrie de masse)
Purification (Chromatographies liquides, basse, moyenne et haute pression)
Mise en place de protocole identifié dans la littérature, optimisation des protocoles, développement des techniques
Analyse quantitative et qualitative des glycanes sur leur support moléculaire (lipide, protéine ...)
Analyse des modifications post-traductionnelles
Analyse de Thermal Proteom Profiling (CETSA)

La plateforme possède un parc technologique varié afin de répondre à vos demandes d’analyse des glycanes seuls, des glycopeptides et de glycoprotéines entières.
Nous proposons aussi la réservation de nos machines aux personnes ayant suivi, au préalable, une formation avec un membre de la plateforme.

Polytech Montpellier, CHU-Nantes, Université du Littoral Côte d'Opale...
Université de Nagoya (Japon), Université de Sheffield (Royaume-Uni)…