Plateforme de glycomique et protéomique

PAGès-P3M
Biologie et santé Plateforme Santé de précision Sciences pour une planète en mutation

PAGés-P3M est l'unique plateau français labélisé IBiSa dédié à l’analyse globale des glycanes seuls, des glycopeptides et de glycoprotéines entières. Issu et adossé à l’Unité de Glycobiologie Structurelle et Fonctionnelle UMR8576, PAGés-P3M profite de 20 ans d’expérience dans l’étude des glycosylations. La plateforme dispose de solides expertises en :
- RMN, chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse pour l’identification des sucres et glycannes complexes,
- analyse glycoprotéomique pour la localisation des glycosylations,
- spectrométrie de masse des glycoprotéines entières pour la quantification des glycoformes et l’étude des interactions avec ligand ou protéine partenaires. Ouvert aussi bien au monde industriel qu'au monde académique, PAGés-P3M propose de répondre à vos besoins quel que soit votre projet : formation, utilisation d’instrument, prestation, développement.

Informations

Responsable technique : Nao Yamakawa
Responsable scientifique : Jean-Michel Saliou (P3M)
Responsable scientifique : Emmanuel Maes (PAGés)

https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/glycomique-proteomique

Bâtiment C9, Avenue Mendeleiev
Campus Cité Scientifique, Université de Lille
59655 VILLENEUVE D'ASCQ

Mots-clés

Glycomique, Glycoprotéomique, Protéomique, Polysaccharides, Oligosaccharides, Glycolipides, Gangliosides, Glycoproteines, Chromatographie, Spectrométrie de Masse

Localisation

  • Composition et quantification en monosaccharide
  • Etude de mélange complexe de glycanes, poly- et oligo-saccharides
  • Glycobiologie structurale
  • Spectroscopie RMN (résonance magnétique nucléaire)
  • Protéomique haut débit
  • Etude des modifications post-traductionnelles
  • Glyco protéomique
  • Spéctrométrie de masse native
  • Séquence primaire, configuration et anomérie de glycannes
  • Détermination de l’état de sialylation
  • Etude d’interaction moléculaire biospécifique
  • Purification de biomolécules
  • Chromatographie en phase gazeuse
  • Chromatographie liquide
  • Spectrométrie de Masse
  • Approches multi-techniques
  • Quantification avec ou sans marquage

Exemples de projets :

  • Analyse structurale des glycannes et glycoconjugués sous toutes leurs formes, i.e. glycolipides, glycoprotéines, polysaccharides, oligosaccharides.
  • Analyses de composition en monosaccharides (chimie, phase gazeuse, spectrométrie de masse, RMNprotons et hétéroatomes)
  • Analyse quantitative des glucides dans des mélanges complexes et des matrices.
  • Analyse protéomique quantitative (immunopeptidome, interactome, proteome complet)
  • Analyse glycoprotéomique
  • Analyse de masse native (LC-MS, ESI-MS)
  • Quantification et dosage en monosaccharides
  • Analyses de séquences (spectrométrie de masse, RMN)
  • Analyses des cartes glycaniques de glycoprotéines (spectrométrie de masse)
  • Purification (Chromatographies liquides, basse, moyenne et haute pression)
  • Mise en place de protocole identifié dans la littérature, optimisation des protocoles, développement des techniques
  • Analyse quantitative et qualitative des glycanes sur leur support moléculaire (lipide, protéine ...)
  • Analyse des modifications post-traductionnelles  
  • Analyse de Thermal Proteom Profiling (CETSA)

La plateforme possède un parc technologique varié afin de répondre à vos demandes d’analyse des glycanes seuls, des glycopeptides et de glycoprotéines entières.
Nous proposons aussi la réservation de nos machines aux personnes ayant suivi, au préalable, une formation avec un membre de la plateforme.

Polytech Montpellier, CHU-Nantes, Université du Littoral Côte d'Opale...
Université de Nagoya (Japon), Université de Sheffield (Royaume-Uni)…