Génomique fonctionnelle (epi)métabolique et mécanismes moléculaires impliqués dans le diabète de type 2 et les maladies associées

EGENODIA | UMR 8199 - U 1283
Biologie et santé Unité de recherche Santé de précision

Les objectifs de notre unité sont d’identifier de nouveaux gènes impliqués dans le diabète et l’obésité, et de mieux diagnostiquer les formes de diabète et obésité d’origine génétique permettant ainsi une médecine personnalisée selon le sous type génétique. L’ensemble de nos travaux a aussi pour but de mieux stratifier les facteurs de risque génétiques et environnementaux, et les causes génétiques primaires, des maladies métaboliques aux différents âges de la vie. Nous développons des concepts translationnels pour permettre des thérapies individualisées des patients obèses et des patients diabétiques. Différentes approches « multiomics » sont menées au moyen de notre plateforme de génomique unique en France LIGAN-PM (séquençage haut débit d’ADN et ARN, génotypage et analyse transcriptomique par puces à ADN, comptage moléculaire digital via la technologie NanoString).

Informations

Direction : Philippe Froguel

http://www.good.cnrs.fr/
https://twitter.com/UMR1283

1, place de Verdun
Faculté de Médecine - Pôle Recherche, Université de Lille
59045 LILLE

Mots-clés

Génétique, (Epi)génétique, Obésité, Diabète, Biologie cellulaire, Médecine personnalisée, Maladies métaboliques, Physiopathologies, Mécanismes moléculaires, Endocrinologie

Localisation

  • Génétique des maladies métaboliques
  • Prédiction, prévention et thérapie du diabète et de l'obésité
  • Thérapie personnalisée des maladies métaboliques
  • Génétique et épigénétique du diabète et de l'obésité
  • Bases moléculaires et modélisation du diabète et de l'obésité
  • Préparation et gestion de BioBanque
  • Séquençage haut débit (NGS) + analyses (bioinformatiques & biostatistiques)

Exemples de projets :

  • ERC Reg-Seq: Functional genomics of non-coding mutations in regulatory regions of four metabolic tissues, and their involvement into type 2 diabetes through large-scale sequencing
  • PreciDiab National Center for Precision Diabetic Medicine
  • Préparation et l’extraction d’ADN, d’ARN à partir de sang ou de tissus, de salive et de culot cellulaire
  • Génotypage
  • Analyse d'expression
  • Séquençage NGS
  • Analyse bioinformatique et statistique

Matériel biologique

  • Lignées cellulaires : modèles de cellules bêta murines et humaines
  • Modèles murins : Knock-out spécifique au tissu, surexpression, modèle physiologique pour l'analyse des perturbations métaboliques...
  • Collections biologiques : ADN de différentes cohortes de patients

Privés
Nombreuses collaborations avec l'industrie pharmaceutiques et les sociétés de biotechnologies : Sanofi, Servier, Eli Lilly, Enterome, etc.
2 RHU en cours : iMAP avec en partenaires privés ILTOO Pharma et IMMUNOTECH BECKMAN COULTER et PreciNASH avec SANOFI

Académiques
PARCC (Université de Paris), Université de Nice, ...
Imperial College London (Royaume-Uni), University of Jena (Allemagne), Lund University (Suède), University of Oxford (Royaume-Uni), Harvard University (Etats-Unis), Leiden University (Pays Bas), Helmholtz Association (Allemagne), Wellcome Centre for Human Genetics (Royaume-Uni), Shriners Hospitals for Children (Etats-Unis), ...

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